Quelques contributions à l'analyse statistique et à la classification des graphes et des courbes : applications à l'immunobiologie et à la reconstruction des réseaux biologiques
Institution:
Montpellier 2Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
This thesis proposes a set of results in the domain of statistical learning and supervised classification, both from a theoretical and an algorithmic point of view, along with several real-world applications. The thesis is divided into two independent research projects. The first project, essentially theoretical, involves studies into the reconstruction of biological networks, as well as the analysis and classification of time series. The second project presents the results of a statistical study undertaken in collaboration with immunobiologists from Montpellier University 2, in which a step by step analysis of the rearrangement of genes in the formation of T cell receptor junctions was undertaken. Since this domain is very young, we had to first propose a system of notation for the biological variables of interest. We then developed statistical analysis methods aiming to better understand the physical processes implicated in these rearrangements, which are at present little-understood
Abstract FR:
Cette thèse propose un ensemble de résultats dans le domaine de l'apprentissage statistique et de la classification supervisée, tant du point de vue théorique que du point de vue de l'algorithmique et des applications sur données réelles. Elle se décompose en deux projets de recherche indépendants. Le premier projet, qui porte sur des travaux de nature essentiellement théorique, trouve sa source dans le domaine de la reconstruction des réseaux biologiques et dans l'analyse et la classification des séries temporelles. Le second projet présente les résultats d'une étude statistique réalisée en collaboration avec une équipe d'immunobiologistes de l'Université Montpellier II, où il a s'agit d'analyser, étape par étape, les processus de réarrangement de gènes au sein des jonctions des récepteurs T de notre système immunitaire. La nouveauté de ce domaine nous a amenés à proposer un système de notations pour les variables biologiques d'intérêt et à développer des méthodes d'analyses statistiques visant à mieux comprendre les processus physiques impliqués dans ces réarrangements dont les mécanismes sont encore très mal connus